Jerzy Kluger sinh ra ở Kraków, Ba Lan vào ngày 4 tháng 4 năm 1921 và lớn lên ở Wadowice.[2] Cha của ông Wilhelm là một luật sư. Klugers là thành viên của cộng đồng Do Thái ở Wadowice, trong đó Wilhelm là chủ tịch, nhưng ông vẫn khăng khăng rằng gia đình mình pha trộn giữa bản sắc Do Thái và thế tục (thế tục là trạng thái trung lập, trong đó chủ thể tách biệt khỏi tôn giáo). Cộng đồng người Do Thái ở Wadowice có quan hệ tốt với những người hàng xóm Công giáo của họ, mặc dù vẫn tồn tại chủ nghĩa bài Do Thái.[3]